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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

数说山西政协五年“成绩单”：社会、经济建设类提案超八成******

　　中新网太原1月12日电 (记者 李庭耀)政协委员、政协各参加单位和政协各专门委员会共提出提案5677件，经审查，立案4838件，立案率为85%。截至目前，山西省委、省政府及各提案承办单位对交付的4838件提案按规定要求全部予以办复，委员满意率在98%以上……12日，山西省政协十三届一次会议正在进行，记者获悉，过去五年，山西省政协的社会、经济建设类提案占比超八成。

　　受政协第十二届山西省委员会常务委员会委托，山西省政协十三届一次会议主席团常务主席、第一次全体会议执行主席席小军向大会报告过去五年提案工作情况。他表示，总体来看，十二届山西省政协提案，数量稳步增加、质量不断提高，反映内容聚焦中心工作，意见建议关乎民生期盼，着力点契合党委政府工作部署，充分表达了社会各界的愿望和呼声。

　　过去五年，山西省政协经济建设类提案1941件，占40.12%。内容主要涉及深化供给侧结构性改革、太忻一体化经济区建设、推进“两个转型”、推动能源领域“五个一体化”、构建现代产业体系、促进民营经济发展等方面。

　　其中，关于推进钢铁产业链供应链优化升级、建设智能制造高新技术产业基地、优化重点项目投资结构等建议，为推动转型综改发挥了作用。关于实施供给侧结构性改革、深化国资国企改革、支持小微企业纾困发展等建议，为促进经济高质量发展献计献策。关于推动煤炭“减”“优”“绿”、优化转型产业布局、推进先进轨道交通装备和煤机智能制造产业发展等建议，在编制该省“十四五”规划中予以采纳。

　　政治建设类提案178件，占3.68%。内容主要涉及发挥统一战线作用、推进法治山西建设、贯彻总体国家安全观、优化营商环境、强化基层党组织建设等方面。

　　其中，关于提升多党合作制度效能、铸牢中华民族共同体意识等建议，为巩固和发展爱国统一战线发挥了积极作用。关于发展新时代“枫桥经验”、推进党群服务中心建设等建议，为提高基层治理能力发挥了作用。关于推进政务数据共享、完善民营企业诉求维权机制等建议，为优化营商环境提供了参考。

　　文化建设类提案386件，占7.98%。内容涉及培育和践行社会主义核心价值观、传承中华优秀传统文化、建设文化强省、推动文旅深度融合发展等方面。

　　其中，关于加强革命遗址保护、党史教育基地建设等建议，为山西省红色旅游资源开发、精神文明建设发挥了建设性作用。

　　社会建设类提案2095件，占43.3%。内容涉及打赢脱贫攻坚战、完善疫情防控机制、养老服务体系建设、推进“双减”政策落实等方面。

　　其中，关于实施农村干部学历提升工程、实施公费农科生定向培养、培育新型农业经营主体、推广农业生产托管服务模式等建议，在山西省太行山区、吕梁山区迈上小康社会中发挥了作用。关于深化医保支付方式改革、加强义务教育资源均衡配置、完善三孩生育配套措施、推进养老服务体系建设等建议，为健全完善社会保障体系贡献了智慧。

　　生态文明建设类提案238件，占4.92%。内容涉及践行“两山”理论、污染防治综合治理、推动绿色低碳发展等方面。

　　其中，关于加强建筑废弃物资源化利用、推进环境保护网格化监管、加快新能源汽车推广等建议，为打好污染防治攻坚战起到了促进作用。关于推动黄河流域生态保护和高质量发展、推进国土绿化、统筹林草植被保护修复等建议，为山西省生态保护工程有力推进贡献政协力量。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）