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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

蒋万安就任台北市长受瞩目，台媒：迎面而来的即是市政问题******

　　【环球时报综合报道】台湾22个县市12月25日举行县市长就职典礼，其中台北市长蒋万安最受关注。

　　台北市长交接典礼25日在台北市政府举行，新任台北市长蒋万安在“行政院副院长”沈荣津监交下，从卸任市长柯文哲手中接过印信。马英九、前台北市长黄大洲、国民党副主席连胜文等人都到场观礼。台湾经济日报网称，柯文哲在分享经验时表示，面对庞杂的市政常常会遇到很多困难，每次他都问同仁一个问题，“如果50年后再回头看这个问题，我们现在要怎么做决策？”这样大家就很清楚应该选择哪一个政策了。

　　岛内对于这名卸任市长的未来动向很关注。当被问到对2024年选举准备如何时，柯文哲回应说“平常心就好”。

　　新任台北市长蒋万安在致辞时表示，他上任后有四大优先重点工作，包含疫后重启、留住人才、推动智慧建设以及推广台北地方特色。他说，他提出的政见“一个台北、四项发展、五个中心”获得了台北市民的认可，带着这份托付，“我会把台北的资源与潜力联结起来，彰显台北的特色，体现‘越在地、越国际’的理念，奠定台北成为世界级城市的基础”。媒体询问马英九对蒋万安有什么期许，马英九说，“好好干，做市长不容易，就是要很努力”。

　　网络温度计25日称，蒋万安刚上任，迎面而来的即是千头万绪的市政问题，台北市是台湾政治、经济、教育以及文化中心，“因此如何带领台北市走出新格局，突破过去几年在疫情影响之下的困境，绝对是新任市长的责任与挑战”。文章列举了蒋万安将面临的难题，包括高房价、人口外流以及生育率低等。

　　25日，22个县市还举行了正副议长选举。议长部分，国民党获得压倒多数的15席，民进党4席、无党籍3席。副议长部分，国民党12席、民进党2席、无党籍7席、亲民党1席。而在台北市议会共61名议员中，国民党籍的戴锡钦和叶林传当选正副议长。联合新闻网注意到，台湾民众党4名议员都支持国民党的戴锡钦。(陈立非)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）